化学肥料や農薬を使用しない有機農法にも次亜塩素酸水の使用は認められている。
その目的は生体を構成する細胞膜、タンパク質、核酸などの有機化合物に
多面的に作用して酸化的に損傷を与えることである。
除草剤の散布後は強烈な塩素臭が残る。